干旱胁迫下耐旱野生百脉根抑制消减文库构建与分析

来源 :农业生物技术学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bhc880913
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
百脉根(Lotus corniculatus)是一种具有广阔应用前景的豆科牧草,但推广利用效率受干旱影响严重.为解决这一问题,本课题组经过多年研究,筛选出了高耐旱性百脉根种质B08,为进一步研究B08种质的抗旱机理,本实验运用抑制消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术构建了B08百脉根干旱胁迫诱导基因表达的正反向抑制消减杂交cDNA文库,从正反向文库中各随机挑选600个阳性克隆进行测序分析,结果表明:(1)正反向文库分别得到574条和595条高质量序列,平均长度分别为207.5和242.7 bp.对高质量序列数据进行数据组装,最终得到632条unigenes序列,其中正库获得178条,反库获得454条.(2)将获得的632条unigenes序列与公共数据库进行BLAST比对,最终有147条序列被注释成功,其中80条是功能已知的基因,67条是功能未知基因,此外还发现了485条新基因.(3)对NCBI Non-Redundant Protein Sequence Database(nr)注释结果进行物种统计,结果显示与毛果杨(Populus trichocarpa)、苹果(Malus domestica)、菠菜(Spinacia oleracea)、大麦(Hordeum vulgare)、油菜(Brassica napus)、木豆(Cajanus cajan)、鹰嘴豆(Cicer arietinum)、中果咖啡(Coffea canephora)等同源性较高.对正反文库筛选到的序列进行基因本体(Gene Ontology,GO)功能分类,结果显示参与细胞、细胞成分、细胞器、结合活性、代谢过程、催化活性、细胞过程的序列所占比例较大.(4)获得的unigenes涉及植物光合作用、能量代谢、激素的合成、蛋白质代谢、核酸代谢、离子转运和信号转导等.(5)发现了和植物抗旱机制密切相关的丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶(serine/threonine-protein phosphatase)、类钙调素蛋白(calmodulin-like protein,CML)、吲哚-3-乙酸诱导蛋白ARG7(indole-3-acetic acid-induced protein ARG7)、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK).本研究结果为下一步克隆并验证百脉根抗旱相关基因、发现抗旱相关新基因、研究百脉根抗旱分子机制以及培育高抗旱性百脉根品种提供了基础资料.
其他文献
The security of CPU smart cards,which are widely used throughout China,is currently being threatened by side-channel analysis.Typical countermeasures to side-ch
伴随着民航企业市场经济体质的发展,民航企业改革开放的程度不断加深,民航企业思想政治工作的开展也必须符合时代发展的要求,进一步通过创新的方式来解决民航企业员工思想政治工
团的基层组织是团的全部战斗力和基础,高校基层团组织作为高校党群系统的重要子细胞,其承担着组织青年、引导青年、服务青年和维护青年合法权益的重要职责.在共青团中央、教
为探究吕家坨井田地质构造格局,根据钻孔勘探资料,采用分形理论和趋势面分析方法,研究了井田7
期刊
马克思在《导言》和《论犹太人问题》两篇文章中从“未成熟的解放”引出“人的解放”,阐述了政治解放和人的解放的不同一性,提出人的解放才是真正实现个体自由的最根本途径,即使
素质教育在中国试验的失败,让国人对中国的教育制度产生了怀疑和困惑。但我们不能否认素质教育提出的建设性意义,本文就素质教育中的重要部分——德性教育出发,结合中国传统优秀
大学生思想政治教育的质量事关民族命运和国家发展,而中国梦所蕴含的强大精神能量是大学生思想政治教育关注的重点.党的十八大以来,各地高校积极响应,将中国梦教育融入大学生
检察院在行使法律权利的过程当中将会产生大量的诉讼档案,而这些诉讼档案能够真实反映基层检察机关的工作情况,同时直接决定检察机关能否满足人民群众对其利用需求,因此妥善管理
在新课改的背景下,小学语文教师的教育教学方式也发生了诸多变化,即从原来单纯的知识教学,变为更加注重学生综合学习能力的提高,而这其实也是小学语文教育教学高效课堂构建的