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目的 建立目的基因差异信息标量化的配对研究体系,比较经典的代表性差异分析(RDA)方法和消减杂交差异显示分析(SHDD)方法在克隆差异基因方面的灵敏度.方法 以人类乳头瘤病毒(HPV)DNA为模板行PCR扩增获得376 bp和869 bp两个片段.作为差异日的基因掺入人血基因组DNA,获得5组目的基因拷贝数呈梯度差异的配对研究体系,比较RDA和SHDD方法的检测灵敏度.结果 应用RDA方法可克隆得到上调6倍的376 bp片段和上调8倍的869 bp的HPV片段,而应用SHDD方法可克隆到上调4倍的两种差异片段.结论 SHDD 方法由于采用了两样本差异产物间的双向均衡消减杂交,避免了经典RDA方法不均衡消减杂交导致的差异信息的丢失,在克隆较弱的差异信息,尤其是较长差异信息方面,显著优于经典RDA 方法。