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北京市医药分开改革的路径是本着患者负担不增加、医院收益不减少、政府财政和医保基金能承受的原则。在以人为本的前提下，确定了通过医保、价格、财政多方联动，将药品加成和挂号费、诊疗费与设立的医事服务费“平移转换”的方式，转变公立医院补偿渠道，最终实现医药分开改革的路径。其具体内容有三：第一，取消15％的药品加成，即：所有药品按进价出售；第二，取消挂号费和诊疗费；第三，设立医事服务费。