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【目的】利用选择信号分析方法在伊犁鹅和霍尔多巴吉鹅中筛选与产蛋性状相关的候选基因。【方法】选取健康状况良好、饲养管理水平一致的2岁伊犁鹅母鹅和霍尔多巴吉鹅母鹅各24只，采集血液样本，提取基因组DNA,利用全基因组重测序技术进行选择信号检测分析，筛选出受到选择的候选区域，针对注释基因进行GO功能和KEGG通路富集分析，进一步筛选出与鹅产蛋性状相关的候选基因。【结果】全基因组重测序的平均测序深度为15.28×,与参考基因组比对率在97.31%以上。通过群体分化指数（Fst）对伊犁鹅和霍尔多巴吉鹅2个群体进行分析，共筛选到1 231个候选区域。与核苷酸多样性（Pi）进行联合分析后，伊犁鹅群体共筛选出10个候选区域，得到5个注释基因；霍尔多巴吉鹅群体中共筛选出353个候选区域，得到263个注释基因。GO功能和KEGG通路富集分析发现，初步筛选出6个可能与鹅产蛋性状相关的候选基因（BMP2、BMP6、MIS、ENO1、LIF、EP300）,还发现了IL-18基因可能与禽类的免疫有关。【结论】本研究筛选出6个可能与鹅产蛋性状相关的候选基因，为揭示鹅产蛋性状的分子调控机制提供了参考。