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对桉属（Eucalyptus）的11个种和3个无性系的ITS序列进行了比对分析,桉属的不同种以及3个无性系的ITS长度范围为633～678 bp。分析表明,3个无性系的ITS为假基因,其ITS序列长度比近缘种长38～45 bp。因此,通过ITS引物扩增和测序可以将无性系与其它种类、品种或类型区分。系统发育分析表明,柠檬桉（Eucalyptus citriodora）、粗皮桉（E.pellita）与尾叶桉（E.urophylla）有比较近的亲缘关系,而巨桉（E.grandis）与窿缘桉（E.exserta）