【摘 要】
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近期研究发现的超级病原菌耐药的原因，是其含有一种特殊的金属内酰胺酶-NDM一1。采用计算生物学技术，通过分子建模、使NDM-1与其它金属β-内酰胺酶类相比对，探索NDM-1对于β-内
【机 构】
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上海大学生命科学学院电子生物研究所,南方医科大学基因工程研究所,华南基因组研究中心
【基金项目】
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资助项目：国家自然科学基金项目（36004416）,广东省领军人才项目（HershkoProject）.
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近期研究发现的超级病原菌耐药的原因，是其含有一种特殊的金属内酰胺酶-NDM一1。采用计算生物学技术，通过分子建模、使NDM-1与其它金属β-内酰胺酶类相比对，探索NDM-1对于β-内酰胺类抗生素具有广谱的水解能力的分子机理，为相关新药的开发提供理论依据。将NDM-1序列用BLAST进行同源性搜索，挑选一些相似性较高的序列进行多序列比对的同源建模，对所得的模型进行评估。根据已知的VIM-2晶体结构，使计算的NDM-1模型活性位点与已知VIM-2金属酶结构进行比较分析；结果发现NDM-1在锌离子结合位点的几个
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