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采用0-1混合型边界元剖分计算域边界面，以提高边界元方法模拟三维波场波浪变形问题的数值计算精度。采用Sponge Layer阻尼消波和Sommerfeld放射条件相匹配的边界处理方式，以消除计算域内的反射波，借助时域内的波面位置追踪，实现了三阶Stokes波在数值波动水槽中的波浪变形计算，其结果吻合于理论值。