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经过长时间的探索和积累,人们已经建立了许多代谢组学数据库,这些数据库虽然所用到的技术手段不尽相同、所收集和公开的数据也存在差异,但是都有各自的特点和用处,同时也有各自的缺点与不足。主要介绍几种用于寻找新型天然活性物质的开放型代谢组学数据库,主要涉及数据库建立的技术手段、数据库包含数据的多少、如何接入查找等方面,同时也给出一些改进的意见,希望以后可以更加完善。