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结肠小袋纤毛虫是呈世界性分布的人畜共患原虫，主要流行于热带和亚热带区域。目前已有30多种动物可感染本病，出现以腹泻为主的病症，其中猪是最主要的易感动物，它通过摄食含小袋纤毛虫包囊的食物、饮水而感染，感染率可高达60％以上。2016年11月，曲靖某家庭式小规模猪场的16头保育仔猪发生顽固性痢疾，笔者依流行病学、临床症状、剖检变化、实验室诊断确诊其为猪结肠小袋纤毛虫病，对症治疗后取得良好效果，现作如下报道。