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水源与饮用水中病原原生动物在世界范围内引起许多大规模的水传染疾病的爆发，美，英，澳、加等国家有多起实例报导。在地表水源、原水、处理水，滤池反冲洗水和最后的饮用水均检出贾第虫和阴胞子虫。最后饮用水中的贾第虫呈阳性的检出率为１４．９％（７／４７），阴胞子虫检出率为２９．８％（１４／４７），其含量平均值为３．２４／１００Ｌ，最大值为２０．８／１００Ｌ。目前用于检测水中小粒阴胞子虫卵囊的方法分为三个阶段，