基于生物信息学对胃癌预后基因的筛选

来源 :世界最新医学信息文摘 | 被引量 : 0次 | 上传用户：chenjason886

【摘要】

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目的通过生物信息学分析筛选胃癌预后相关基因并分析其潜在机制.方法从人类肿瘤基因表达汇编(Gene Erpression Ominibus GEO)数据库下载三个胃癌样本数据集GSE19826、GSE5412

【作者】

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李高勤牛帆苏欢李俊杰宋忠阳祁亚峰雍文兴张志明

【机构】

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甘肃中医药大学,甘肃中医药大学附属医院

【出处】

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世界最新医学信息文摘

【发表日期】

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2020年97期

【关键词】

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生物信息学分析基因芯片胃癌差异表达基因 Bioinformatical analysis Microarray Gastric cancer Differ

【基金项目】

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甘肃省中西医结合肿瘤临床医学研究中心,基金号:18JR2FA001

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目的通过生物信息学分析筛选胃癌预后相关基因并分析其潜在机制.方法从人类肿瘤基因表达汇编(Gene Erpression Ominibus GEO)数据库下载三个胃癌样本数据集GSE19826、GSE54129和GSE79973.利用GEO2R在线工具和Venn作图软件筛选胃癌组织和正常胃组织差异表达基因(DEGs),利用DAVID数据库对DEGs做GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,接着利用STRING工具对这些DEGs构建蛋白质互作(PPI)网络,用分子复合物检测(MCODE)插件通过分析PPI网络

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