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分析2016年引起河南省一次流行性腮腺炎暴发的病毒基因特征,为我省流行性腮腺炎防控提供实验室数据。
方法在2016年河南省的一次流行性腮腺炎暴发中采集患者咽拭子标本,经病毒分离和基因定型后,选取1株进行全基因序列的测定,使用MEGA7.0软件构建系统进化树并计算遗传距离(P-distance),同时对腮腺炎病毒(mumps virus, MuV)小疏水蛋白(SH)、融合蛋白(F)和血凝素神经氨酸酶(HN)编码基因进行基因特征分析。
结果在河南省的一次流行性腮腺炎暴发中共采集了5份咽拭子标本,通过病毒分离共获得5株MuV分离株,进化树分析显示均为F基因型,与F基因参考株P-distance为0.047(0.046~0.049),5株分离株核苷酸P-distance为0.001(0~0.003)。选择其中1株进行全基因组序列测定和分析,与参考基因组序列相比,P-distance为0.053(0.018~0.072),其中与F基因型最小为0.018,与疫苗株(HQ416907)相比,SH基因的第28~30位氨基酸三联体为IML,F基因影响病毒致病特征的第91、195和383位等氨基酸位点未发生突变,HN基因影响病毒免疫特征的区域发生P354Q、E356D和K464N的突变。
结论2016年引起河南省一次流行性腮腺炎暴发的MuV为F基因型,其基因特征与国内流行株较为相似。