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针对傅里叶变换检测非整数次谐波有频谱泄露,检测精度不高等缺点,将一种子空间算法———矩阵束算法应用到非整数次谐波的检测领域,得到了较为理想的检测效果。通过MATLAB的m文件实现了矩阵束算法和傅里叶变换算法,然后分别从噪声和采样点数少对检测结果的影响两方面,对两种算法的检测精度进行了分析比较,结果表明矩阵束算法在非整数次谐波检测方面性能优越。