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猪感染PCV2（圆环病毒2型）会损害机体免疫器官，导致B淋巴细胞和T淋巴细胞减少从而造成免疫抑制，周庆雨、王帅、HuangYL等研究也表明，PCV2感染会抑制免疫应答，降低疫苗免疫效果，甚至阻碍仔猪从奶水中获得母源抗体。但是，也有人认为PCV2的隐性感染对猪瘟、猪口蹄疫等免疫应答不产生抑制作用或者影响不显著，甚至有关于PCV2感染提高猪瘟免疫抗体水平及合格率的报道。