目的了解南通市消除疟疾项目启动初期各级医疗卫生机构疟疾镜检能力建设状况。方法调查全市2011年各级医疗卫生机构疟疾镜检站建设、镜检人员和硬件配备、镜检技能培训等情况;调查各级医疗卫生机构开展"三热"病人血片疟疾镜检工作开展情况等镜检站镜检工作运行状况;调查各县(市、区)和市级疾病预防控制机构开展疟疾镜检员培训考核及血片抽查复检工作等。结果2011年,全市9个县(市、区)共建有204家疟疾镜检站,镜检员228人,显微镜255台;98.68%(225/228)的镜检员接受了疟原虫检验理论和操作技能培训,培训考核合格率为98.67%;共开展疟疾血检57 893人,全年人群总血检率为0.76%。抽查复检乡(镇)门诊镜检站的血片制作、染色和清洁度平均合格率分别为87.14%、86.69%和85.61%,57家医疗机构平均合格率分别为86.82%、86.01%和84.97%;个别乡(镇)和县级疾病预防控制机构未设镜检站,少部分乡(镇)门诊镜检站未开展血检工作或血检质量不符合要求。结论南通市各级镜检站大部分能按要求开展疟疾镜检工作,运行良好。但对照江苏省消除疟疾行动计划要求,仍需加强镜检站能力建设,加强督查,提高血检覆盖率和血检工作质量,确保全市2017年达到消除疟疾标准。