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码头物流系统包括集装箱的装卸、运输、堆码和集疏运作业等，该系统具有动态性、随机性、可伸缩性、复杂性等特点。码头物流运作系统的各个过程都涉及到如何合理高效使用码头提供或配备的设施设备。针对此，提出基于MAS（MultipleAgentSystem）理论的码头管理模型。建立多Agent模型的码头生产调度系统，来协调码头各个子系统之间的对接工作，提高集装箱的管理效率，提高码头的工作效益。以南京某码头实际系统架构应用为例，表明了模型的可行性、有效性、可扩展性、移植性。