非树型网络模体发现算法

来源 :电子学报 | 被引量 : 1次 | 上传用户：wlliser3d

【摘要】

：

现有的大多数网络模体发现算法发现网络中的确切模体,但是由于生物数据是不完整的,有噪声的,而且生命过程具有动态性,概率网络模体具有更实际的意义.本文提出了非树型网络模体发现算法,寻找由一组相似子图组成的概率网络模体.在该算法中,首先提出子图挖掘算法ESN挖掘网络中所有给定规模的非树型子图,然后进行多图比对,最后基于统计模型和对应的得分函数,用模拟退火算法求得网络模体.对E.coli和Yeast的基因

【作者】

：

覃桂敏高琳周晓锋

【机构】

：

西安电子科技大学计算机学院,西安电子科技大学软件学院

【出处】

：

电子学报

【发表日期】

：

2009年11期

【关键词】

：

生物网络概率网络模体子图挖掘 biological networks probability network motifs subgraph minin

【基金项目】

：

国家自然科学基金（No.60574039）,教育部博士点基金（No.200807010013）,陕西省自然基金（No.SJ08-ZT150）,NSFC-微软亚洲研究院联合资助（No.60933009）

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