目的建立食管鳞癌诊断预测模型,寻找食管鳞癌潜在肿瘤标志物。方法收集59例食管鳞癌患者及57例体检健康者血清标本,按照3∶1随机分为训练组(患者44例,健康人对照42例)和验证组(患者15例,健康人对照15例)。弱阳离子交换磁珠(WCX-MB)提纯血清蛋白质/肽后,经基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)检测,筛选出差异表达蛋白质/肽,构建诊断预测模型并初步验证。结果经Clin ProTools软件分析,共筛选出差异多肽峰31个(P<0.05),其中18个峰差异有统计学意义(P<0.01);与健康人对照组相比,8个峰在食管鳞癌组中表达上调; 10个峰在食管鳞癌组中表达下调。其中差异峰m/z 2 660.84和m/z 5 336.49的ROC曲线下面积(AUCROC)分别为0.95和0.91,且均在食管鳞癌组中表达上调。应用遗传算法(GA)建立的食管鳞癌诊断预测模型经验证其准确性为93.10%,敏感性为92.90%,特异性为93.30%。结论建立的食管鳞癌诊断预测模型能较好的用于食管鳞癌辅助诊断,多肽峰m/z 2 660.84和m/z 5 336.49有望成为食管鳞癌潜在肿瘤标志物。