【摘 要】
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20世纪70年代,Ohno提出了功能蛋白的起源理论,认为寡肽片段的周期性重复是蛋白质起源的一种方式. 蛋白质内部重复片段在蛋白质序列进化的过程中具有重要意义.选取原核生物、
【机 构】
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浙江大学生命科学学院,中国科学院遗传与发育生物学研究所
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20世纪70年代,Ohno提出了功能蛋白的起源理论,认为寡肽片段的周期性重复是蛋白质起源的一种方式. 蛋白质内部重复片段在蛋白质序列进化的过程中具有重要意义.选取原核生物、古细菌、真核生物的8个代表物种,设计了新的蛋白质内部重复片段的提取方法,并用矩阵的方式对重复片段的类型及其出现的频率进行形象地展现,既保留了重复片段的序列特征又可进行全局性的统计描述.分析表明:真核生物高频率的使用简单重复序列;真细菌也具有低频率使用简单重复序列的现象;而古细菌则几乎没有.进一步研究显示,3大种群生物偏向性使用氨基酸构成
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