为探明生物有机肥对热区烤烟栽培根际微生态的影响方式及作用规律,以云南热区连作植烟根际土壤为研究对象,采用HPLC检测和Illumina MiSeq高通量测序技术,分析不同施肥处理对烤烟根际土壤中7种酚酸及细菌群落结构的影响.结果表明,2种生物有机肥处理(T1、T2)均可降低烤烟根际土壤中酚酸类自毒物质的含量,与CK相比,T1处理烤烟根际土壤中对羟基苯甲酸、丁香酸、4-香豆酸的含量分别显著降低了33.33％、26.11％、19.51％(P<0.05),T2处理分别显著降低了27.50％、28.03％和19.92％(P<0.05);T1、T2处理的酚酸类物质总量较CK分别显著降低了12.15％和10.61％(P<0.05);施肥处理后有利于提升烤烟根际土壤中细菌群落的多样性指数和丰富度指数,与CK相比,T1、T2处理的OTU丰度分别增加了8.06％和14.48％、Shannon指数分别增加了0.49％和2.95％、ACE指数分别增加了5.21％和16.50％、Chao1指数分别增加了4.46％和15.23％;不同施肥处理细菌优势菌群和相对丰度有差异,T1处理中鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、假节杆菌属(Pseudarthrobacter)、慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)的相对丰度分别较CK增加了91.72％、106.94％和27.48％,同样,T2处理中上述三者相对丰度较CK分别增加了46.03％、101.73％和39.69％.环境因子关联分析表明,烤烟根际土壤中酚酸类自毒物质的含量与部分土壤细菌群落有显著相关性,其中鞘氨醇单胞菌属、假节杆菌属与对羟基苯甲酸、4-香豆酸以及酚酸物质总量均呈显著负相关;芽孢杆菌属(Bacillus)、慢生根瘤菌属分别与阿魏酸、丁香酸和4-香豆酸亦呈显著负相关.说明生物有机肥对植烟土壤有一定的改良与提质效应,有利于创造健康的根际微生态环境,研究可为生物有机肥在云南热区烟田有效利用提供科学依据.