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ISSR标记是一种基于微卫星序列发展起来的十分有效的分子标记。采用ISSR技术利用筛选出的19个ISSR引物（ISSR primers）在9份茶树亲本及其杂交后代中进行遗传分析和鉴定。结果表明，9份茶树间的GS值变化范围为0．594-0．797。其中蜀永307和蜀永906之间的GS值最大、遗传相似程度最高、遗传距离最近；云南大叶茶和四川中小叶种之间的GS值最小、遗传相似程度最低、遗传学差异最大。聚类分析将9个品种划分为3个大类，云南大茶树、蜀永1号为一类；黎儿茶为一较原始的材料，单独成一类；蜀永307、蜀