虎眼万年青鳞茎转录组特性分析

来源 :分子植物育种 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangtan2
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
虎眼万年青具有很高的药用价值和经济价值,鳞茎是其主要的药用和繁殖器官,然而虎眼万年青鳞茎的分子生物学信息严重缺乏成为制约其研究生产的瓶颈。为获得虎眼万年青鳞茎的转录组信息,应用高通量测序技术对虎眼万年青鳞茎进行测序分析。采用His4000测序平台共获得8.2 G原始数据,经过整理分析后,获得7.6 G有效数据和121 223条Unigene;经过与NR、GO、COG及KEGG等数据库进行比较分析后,56 374条Unigene获得NR数据库的注释,39 263条Unigene获得GO数据库的注释,12 388条Unigene获得COG功能注释,5 405条Unigene参与了新陈代谢途径,2 477条Unigene参与了次生代谢途径,166条Unigene参与了萜类的合成,195条Unigene参与了生物碱的合成,295条Unigene作为转录因子参与新陈代谢过程调控。研究结果为采用生物技术手段提高虎眼万年青的药用成分的含量及改善其园艺性状提供了分子数据。 Ornithogalum evergreen has high medicinal value and economic value. Bulb is its main medicinal and reproductive organs. However, the serious lack of molecular biology information of Ornithogalum bulbum has become the bottleneck restricting its production. In order to obtain the transcriptome information of Ornithogalum bulbum, we sequenced the bulb of Ornithogalum evergreen using high-throughput sequencing. A total of 8.2 G raw data was obtained using the His4000 sequencing platform. After finishing the analysis, 7.6 G valid data and 121 223 Unigene were obtained. After comparing with databases such as NR, GO, COG and KEGG, 56 374 Unigene databases were obtained , 39 263 Unigene obtained GO database notes, 12 388 Unigene obtained COG functional annotations, 5 405 Unigene involved in metabolic pathway, 2 477 Unigene involved in secondary metabolic pathway, 166 Unigene involved in terpenoids Synthesis, 195 Unigene involved in the synthesis of alkaloids, 295 Unigene as a transcription factor involved in the regulation of metabolic processes. The results provide molecular data for improving the content of medicinal components and improving the horticultural traits of Ornithogalum evergreen by biotechnology.
其他文献
在我国转型时期,伴随着市场化的进程出现了许多新的社会现象,其中一个最重要也是最显著的变化,就是社会利益分化以及由此引起的社会利益群体的分化。这种分化对社会发展具有双重
农民是中国人口的绝大多数。农民群体在中国经济、政治和社会发展中一直占有举足轻重的地位。农民生存与发展利益的得失,标志着中国民主政治的兴衰与发育程度,决定着中国经济
请下载后查看,本文暂不支持在线获取查看简介。 Please download to view, this article does not support online access to view profile.
期刊
面对安全生产工作一片空白的街道现状,他从基础做起,实行分类、分级管理,并推行了百分验收活动,探索出适合基层安全监管的新模式。他,就是北京市海淀区八里庄街道安办主任周
本文从公司资本制度的含义和我国现行的公司资本制度入手,着重分析了虚假出资、抽逃出资罪的犯罪构成要件和司法认定中存在的具体问题,并结合我国刑法规定,对完善虚假出资、抽逃
随着新课改的不断深入,生本理念逐渐成为了教学改革的一大关键。化学作为一门实验性较强的学科,对学生的动手能力较其他学科有着更高的要求。本文将从教学活动出发,从以学生
为了剖析大穗型香稻保持系川香29B产量相关性状的遗传基础,本研究以川香29B为母本,美国水稻品种Lemont为父本杂交,构建包含177个家系的重组自交系群体。采用SSR分子标记构建
2010年6月13日,以“安全发展,预防为主”为主题的全国“安全生产月”宣传咨询日活动,在北京现代汽车有限公司拉开帷幕.
看着我们伟大的祖国一天天强大,我们的民族文化艺术越来越受到美国主流社会的关注,我们这些海外游子由衷的感到自豪。在更加热爱祖国的同时,更加需要中华文化能在海外广泛传
请下载后查看,本文暂不支持在线获取查看简介。 Please download to view, this article does not support online access to view profile.
期刊
vs