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国库集中支付制度是科研事业单位财政体系优化改革重要内容和成果,在经费预算、项目采购和资金调用等各方面规范了财务管理流程,保障了经费管理水平和使用效益。但是以现行的国库集中支付制度下经费管理模式与农业科研事业单位实际情况还存在一定矛盾和难点,本文旨在分析分析农业科研单位国库集中支付制度改革下存在的问题,并提出有效应对策略,以期提升农业科研事业单位财务管理力度。