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统一建模语言（UML）已成为一种面向对象建模语言的标准，它吸收了软件工程领域的新方法和新技术。阐述了结合使用J2EE和UML的原因以及如何运用UML实现对J2EE的建模表示，探讨了运用UML对复杂系统建模的过程和方法。这些模型有助于开发人员对中间层（即商业逻辑层）设计的优化，并可有效的实现软件的重组和复用。根据纯面向对象思想，在UML建模研究的基础上，实现Java三层结构的新型农村合作医疗信息系统。