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国库集中支付制度是对财政资金的账户设置和收支缴拨方式的根本性变革。高校实行国库集中支付以来,在制度上、管理上不断加以完善和规范,实现了财政对高校预算执行、资金流向的监管,提高了高校财政性资金的使用效率。国库集中支付制度在执行过程中仍存在着削弱高校融资能力、支付程序繁杂、资金拨付与项目执行时间脱节、缺乏相应的配套改革等不足之处,需要统一思想认识、提高队伍素质、加强制度建设、完善配套改革和加强信息化建设,以进一步完善高校国库集中支付制度。