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跨界流域生态补偿标准的核算是当前生态补偿研究的热点，在不考虑污染物通量情况下，生态补偿标准和生态补偿额可作同一概念。以流域污染物治理总成本和流域内各地区污染物治理成本为媒介，研究太湖流域各地区污染物消减量和地区之间生态补偿额的关系。研究认为，某一地区实际消减量和理论上最优消减量的差值决定了生态补偿的方向和金额，且两种消减量之间的差值和生态补偿额大小成正相关。