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采用致病性测定、营养亲和群测定及PCR特异性扩增3种方法，对新疆棉区采集的35个棉花黄萎病菌代表性菌系进行致病型鉴定。结果表明，新疆棉花黄萎病菌存在强、中、弱3种不同的致病类型，其中以中等致病类型居多。利用营养亲和群方法将新疆棉花黄萎病菌分为2个亲和群，其中1个亲和群中的所有菌系均与标准落叶型菌系相亲和，另1个亲和群中的所有菌系均与标准非落叶型菌系相亲和。利用棉花黄萎病菌落叶型特异引物进行PCR特异性扩增，有3个菌系扩增出550bp的落叶型黄萎病菌特异性片段。用营养亲和群及PCR特异性扩增均进一步证实目前