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介绍了一种设计，合成与克隆人造核酶的新方法，通过在“锤头结构”模型中非保守性区域引入ＢｇｌⅠ切点，不仅维持了核酶切割活性所必需的二级结构，而且为核酶克隆的鉴定提供了极为方便的手段。另外还通过在核酶模板两端引入限制性内切酶半点切点，一步直接将核酶模板连接，聚合，克隆到体外转录载体上，大大简化了以往核酶克隆的繁琐操作，省时，省力，克隆效率也较高。