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对云南文山地区三七上获得的三七Y病毒（Panax virus Y,PnVY）不同分离物进行了部分ci基因和cp基因的克隆及序列分析,获得的部分ci基因长657 nt,编码219个氨基酸;获得的部分cp基因长834 nt,编码278个氨基酸。所获得的11个PnVY分离物的ci基因之间核苷酸和氨基酸的同源性分别为80.8%～99.8%和91.3%～100%,与其他PnVY分离物的同源性分别为80.8%～98.8%和92.7%～99.5%。所获得的18个PnVY分离物的cp基因核苷酸和氨基酸序列同源性分别为91