为了解南海栉江珧（Atrina pectinata）的群体遗传变异特征,研究利用线粒体DNA COⅠ（细胞色素氧化酶亚单位Ⅰ）基因部分序列对7个群体共191个栉江珧个体进行群体遗传多样性和遗传结构分析。结果显示:在600 bp长的序列中,共检测到113个核苷酸变异位点,定义了73个单倍型。南海北部栉江珧总体呈现较高的单倍型多样性（0.8996）和较高的核苷酸多样性（0.0257）,但L1组内6个群体（汕头、阳江、湛江、海口、琼海、北海）呈现较高的单倍型多样性（0.8133—0.9286）和较低的核苷酸多样性（0.0033—0.0045）。单倍型系统发育树和网络支系图将7个群体划分为L1和L2（防城港群体）两大类群,但L1组单倍型并未表现出与地理位置相对应的谱系结构。F_st分析显示, L1组内6个群体间不存在明显的遗传分化(F_st=–0.0200—–0.0055, P>0.05),但L1组与L2组间存在极显著的遗传分化(F_st=0.8729—0.8821, P<0.01)。L1组的Tajima’s D检验（D=–2.3190, P=0）和Fu’s F_s检验（F_s=–26.8316, P=0）均为显著负值,核苷酸不配对分布呈明显的单峰分布; L2组的Tajima’s D检验（D=–1.4320, P=0.0565）为不显著负值, Fu’s F_s检验（F_s=4.9540, P=0.9620）为不显著正值。以上数据说明, L1组和L2组栉江珧可能已经分化为两个群体, L1组内6个群体具有频繁的基因交流,导致了较高的遗传同质性。