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为理解SMILES表达式中包含的结构信息,判断化合物之间的结构关系,提出一种检测SMILES表达式之间子结构关系的算法。依据常见原子、化学键和原子间的支链关系,将SMILES表达式切割成一个个不可再分的片段,通过比较切片种类、切片对应的数量判断表达式之间是否具有子结构匹配关系。实验结果表明,该算法简单、准确性高,可为化合物检索及MOL文件分类作参考。