【摘 要】
：
针对DNA序列拼接中的重复序列识别及屏蔽问题,通过对前期定长子串方法的改进,提出了一种基于变长子串的新算法。新算法在扫描shotgun集合时,可以搜集到任意长度子串的重复信
【机 构】
：
武汉理工大学华夏学院,华中师范大学计算机科学系
【出 处】
：
武汉理工大学学报：信息与管理工程版
论文部分内容阅读
针对DNA序列拼接中的重复序列识别及屏蔽问题,通过对前期定长子串方法的改进,提出了一种基于变长子串的新算法。新算法在扫描shotgun集合时,可以搜集到任意长度子串的重复信息,进一步精确定位重复序列位置;然后利用变长子串信息对相应的shotgun片段进行预归并,缩减shotgun集合规模。计算机模拟分析表明,新算法识别重复序列较之定长子串方法精确度更高,并可以有效降低拼接时的计算复杂度。
其他文献
将传统的工频整流、功率因数校正和高频逆变环节进行整合,提出了一种新型单级隔离型PWM变换器。详细分析了其工作原理及控制方式,研究了该电路拓扑的输入、输出性能指标及其
采用文献计量学方法，对2002-2010年间重庆维普《中文科技期刊全文数据库》收录的我国科技查新研究论文进行了统计与分析，并就论文发表的年代、期刊、作者、机构及主题五个方面
针对ICF实验数据量大、多学科、多项目的特点，提出了采用Modelica多领域建模与仿真语言进行ICF实验数据处理的建模思路，以使模型的标准统一，可读性强，同时利于ICF实验的知识积累，
随着社会对于艺术领域人才需求的逐渐升级,美术职业学院所开设的课程除了基础的美术绘画学之外,还应该包括雕塑艺术学、陶瓷工艺学等,让学生能够在艺术领域中获得更全面的知