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科学研究与技术开发机构是科技活动的重要机构，承担着基础研究、应用研究和试验发展的主要任务。随着科技体制改革的不断深入，江苏、广东、浙江研究与开发机构的数量、职工人数自2000年以来有所减少，但科技经费筹集总额有所增加，政府资金支持力度逐渐增长。江苏与广东、浙江相比，研究与开发机构数量下降比例和科学家工程师数量下降比例最大；2006年研究与开发机构每千人获得科技投入资金的绝对量和与2000年相比的增幅均排名第三。