高校的科技成果转化率仍然很低的原因是多方面的：一是目前我國高校的非经济属性决定了其对市场需求把握不准确，科学研究和技术开发更多的是基于技术逻辑展开，而没有考虑市场需求，导致科技成果与经济的需要并没有达到统一：只懂技术不懂市场，缺乏足够的市场竞争力；科技成果技术成熟度较低，不能有效地为企业服务。
　　二是国家对高校科技成果转化的政策和激励机制不全。作为评价高校科研主要工作的教育部年度科研统计，也更多地强调的是项目、经费、论文和奖励，仅体现了科技成果的技术价值，而没有考虑其市场价值。尽管2002年3月科技部和财政部联合发布了《关于国家科研计划项目研究成果知识产权管理的若干规定》，其中对在国家的科研经费支持下完成的科技成果产权的归属问题做了明确规定：即成果的知识产权属于研究单位。该规定参照美国1980年发布的“贝多法”（其核心内容是规定在美国联邦政府经费支持下完成的研究成果属于研究单位所有，联邦政府保留对科技成果优先使用的权力，该法案对于美国的科技成果转化和高新技术产业的发展起了很大作用），但在我国，尽管对促进我国的科技成果转化和高新技术产业的发展必将产生深远影响，但目前这个规定的意义还没有被社会各界意识到。而且由于缺乏相应的法规和实施措施，操作性不强。即使是科技成果的知识产权属于研究单位，实际中只是将知识产权的拥有量作为高校衡量学术水平，乃至高校教师考核、评聘的指标，尚未实现知识产权的市场价值。
　　三是高校科技成果信息流通不畅。科技成果是一种无形资产，它只有通过市场流通并运用于生产中才能体现它的真正价值。因此高校科技成果也需要市场，需要把高校与企业有效地联系起来。市场信息广、流通快，科技成果就能及时传输给企业，使企业从众多信息中找出适合自己发展的科技成果，促使高校科技成果尽快转化。但是高校科技成果这种商品不同于一般的生产资料，它有实效性，一旦不能运用于实际，就可能失去价值。
　　另外，我国的科技成果总体水平不高，真正称得上国际一流的极少。在经济全球化中，由于国内市场国际化进程加快，只有真正属于一流水平的成果，才有可能获得高额回报。目前科技成果的评价，评价者主要是专家学者，评判的标准也以学术论文或技术论文为主导，但在成果转化和社会效益等方面考虑不全。企业不愿转化高校的科技成果，宁愿直接引进成熟的国外技术，造成一些高校科技成果无法转化。