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目前辣椒杂种优势的利用已取得很大成效，但是辣椒杂种优势的分子机理仍然不明。辣椒杂种优势的分子机理是一个重要的生物学和农学课题。为比较分析苗期辣椒杂交种（D6×D7，D7×D6）及其亲本（D6、D7）的成熟功能叶转录谱，把4个功能叶cDNA文库在Illumina HiSeq2000平台进行RNA-seq分析。通过转录组测序，共得到0．6亿条原始的reads，经过筛选获得0．44亿条高质量reads（100bp）。基因存在与缺失变异统计结果表明，单亲表达一致型有1068个（6．20％）和7