基于转录组测序探究PM2.5损伤肺上皮细胞BEAS-2B的相关机制

来源 :天津医药 | 被引量 : 0次 | 上传用户：shevafans

【摘要】

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目的研究PM2.5对肺上皮细胞BEAS-2B基因表达的影响,并探讨其可能作用的信号通路。方法BEAS-2B细胞分为对照组(PBS处理)和PM2.5组(200 mg/L PM2.5处理),干预24 h后提取各组细

【作者】

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胡玲娟何翔张雷冉琴李国平

【机构】

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西南医科大学临床医学院,西南交通大学附属医院

【出处】

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天津医药

【发表日期】

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2020年1期

【关键词】

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转录组测序 PM2.5 肺上皮细胞BEAS-2B 差异表达基因 IL-17信号通路 RNA-seqPM2.5lung epithelial cell BEAS-

【基金项目】

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国家自然科学基金资助项目(81970026),四川省卫生健康委员会重点科研课题(19ZD002),四川省卫生和计划生育委员会科研课题(18PJ012),四川省科技计划项目(2018JY0380)

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目的研究PM2.5对肺上皮细胞BEAS-2B基因表达的影响,并探讨其可能作用的信号通路。方法BEAS-2B细胞分为对照组(PBS处理)和PM2.5组(200 mg/L PM2.5处理),干预24 h后提取各组细胞总RNA进行高通量测序。所得的序列经质控,与参考基因组比对,获得用于后续转录本组装、表达量计算的mapped data(reads)后,比对到6大数据库[NR、Swiss-Prot、Pfam、COG(Evolutionary genealogy of genes)、GO(Gene Ontology

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