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目的:面对高分辨率的海量脑片染色信号数据,建立一种统一的方法来便捷的实现多场景下的准确识别.方法:选择5套不同分子标记的小鼠鼠脑荧光图像数据,对比分析了ImageJ和Imaris两种识别方法与人工识别的差异.结果:对于清晰无重叠的荧光信号,Imaris和ImageJ均能进行快速准确地识别.而当图像内信号强度差异较大时,Imaris参数调整的识别结果是实时可见的,且鲁棒性较好,同一参数即可对全部信号进行较准确的量化,但在ImageJ中需要根据信号强度设置不同的参数进行多次识别.结论:Imaris是一种理想的、可以实现快速、方便、准确地识别和计算高通量脑片中荧光信号的方法.