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HLA-SSO基因分型采用序列特异性寡核苷酸（sequence specific oligonucleotide,SSO）引物来鉴定PCR扩增产物中的等位基因。该方法基于标记的单链PCR产物与SSO探针进行杂交,通过PCR扩增,获得单链及双链混合PCR产物,用于扩增的引物标记有生物素,因此扩增所得的PCR产物均被生物素标记。双链PCR产物经过变性解链成单链,所有单链与微珠上的SSO探针特异性结合,然后用荧光标记,之后与生物素结合,利用Luminex平台进行HLA-Ⅰ类和HLA-Ⅱ类等位基因的DNA分型。