基于混合神经网络的人类基因组启动子识别研究

来源 :高技术通讯 | 被引量 : 0次 | 上传用户：lt96047

【摘要】

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提出了基于混合神经网络的人类基因组启动子识别的新方法:PromPredictor.该方法通过对转录起始位点(TSS)信息,调控区、编码区组成成分特征信息及CpG岛相关信息的综合来预测人

【作者】

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陈传波李滔

【机构】

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华中科技大学计算机学院

【出处】

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高技术通讯

【发表日期】

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2005年11期

【关键词】

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启动子预测混合神经网络组成成分 CPG岛 promoter prediction hybrid neural networks compositiona

【基金项目】

：

国家自然科学基金

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提出了基于混合神经网络的人类基因组启动子识别的新方法:PromPredictor.该方法通过对转录起始位点(TSS)信息,调控区、编码区组成成分特征信息及CpG岛相关信息的综合来预测人类基因组启动子.对人类4、21、22号染色体启动子的预测结果为:敏感性达到了64.47%,特异性达到了82.2%.与其它三个算法相比,PromPredictor具有更高的敏感性和特异性.研究中所用到的数据集合及用MATLAB编写的程序代码都可以从www.whtelecom.com/Prompredictor.htm下载得到.

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