【摘 要】
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为探究猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)感染猪小肠上皮细胞(Porcine intestine epithelial cells J2,IPEC-J2)后对IPEC-J2的miRNA表达谱的影响,本实
【机 构】
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中国农业科学院兰州兽医研究所;青岛农业大学动物医学院;
【基金项目】
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“十三五”国家重点研发计划项目(2016YFD500103、2017YFD0501004);国家自然基金项目(31572498、31702209);山东省现代农业产业体系特种经济动物产业创新团队资金(SDAIT-21-13)
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为探究猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)感染猪小肠上皮细胞(Porcine intestine epithelial cells J2,IPEC-J2)后对IPEC-J2的miRNA表达谱的影响,本实验将PEDV感染IPEC-J2,收获细胞并提取其总RNA,进行Hiseq高通量测序,构建感染组与未感染组的miRNA表达谱并进行聚类分析、GO(Gene ontology,GO)分析、KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)代谢通路分析和差异分析,并通过过表达novel-miR-877 mimic和ssc-miR-219a mimic观察PEDV对IPEC-J2复制的影响。结果显示显著差异表达的已知miRNA有45个,未知miRNA有249个,从其中随机挑选了差异表达较显著的16个miRNA并采用qPCR进行验证,结果显示与测序结果一致;对这些差异miRNA进行GO分析,结果显示其广泛参与生物过程、细胞成分和分子功能的调节;通过KEGG代谢通路分析显示miRNA也参与Jak-STAT、Toll样受体等信号通路的调节;通过对novel-miR-877和ssc-miR-219a的过表达,显示PEDV复制均受到显著抑制。本研究为探究miRNA在PEDV复制中的作用奠定了基础。
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