抗氧化肽SHW作用于Keap1-Nrf2通路的分子动力学模拟

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采用分子对接和分子动力学模拟的方法,研究了抗氧化三肽SHW与Keap1蛋白的相互作用,揭示了非竞争性结合的分子机制.分别位于Keap1的P1和P5活性口袋的Keap1蛋白关键残基ARG-415和TYR-525通过与SHW形成氢键来增强结合强度且对结合能有突出贡献. SHW的吲哚基团是与TYR-334、TYR-525和TYR-572形成疏水作用的关键,促进与P5口袋的结合.研究结果揭示了SHW通过Keap1-Nrf2信号通路作用于活性口袋的分子机制,为抗氧化剂的开发提供理论依据.
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