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近十年来，双壳类在水产业中的地位日趋重要。由于对赤潮的发生存有预警作用，其在环境科学中的价值日益受到重视。有关双壳类基因组学和蛋白质组学的研究进展很快。上世纪，双壳类基因组结构、功能和进化等方面的研究才刚刚开始，现在已经开始研究双壳类基因连锁图谱、基因转录和蛋白质组学。与双壳贝类生产性能相关的分子生物学特性研究报道越来越多。主要的研究热点是双壳类重大疾病的易感性、双壳类对环境压力的耐受力以及生长状况的分子基础等。太平洋牡蛎（Crassostreagigas）是目前双壳类基因组关注的焦点，被推荐为首选的双壳