大白菜表达序列标签SSR标记分析

来源 :农业生物技术学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zyz2574100
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对大白菜(Brassicacampestris L.ssp pekinensis)13007个EST序列进行拼接共得到7 714个片段重叠群(contig),其中10.4%(890个)非冗余EST含有SSR标记(EST-SSR),标记间平均间隔距离为3.9 kb,单、双和三核苷酸重复序列大约各占1/3左右.CDS所包含的三核苷酸重复序列最多,而且AAG/CTT重复序列的含量最高.通过同源性比较分析,获得功能已知的SSR-ESTs 774个,共计含有846个SSR,其中50.2%位于5'-UTR,3
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