基于生物信息学分析癫痫相关基因在低级别胶质瘤患者预后中的作用

来源 :中国高原医学与生物学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：dfw002

【摘要】

：

目的基于生物信息学探讨癫痫相关基因对低级别胶质瘤(LCG)患者预后的影响,并初步挖掘其作用机制。方法从NCBI CEO数据库获取伴有或不伴有癫痫的LCG患者的芯片数据(CSE32534);

【作者】

：

梁沛余马晓雨常秀君韩蕙竹夏晓晓解安达吴穹

【机构】

：

青海大学医学院,武汉大学基础医学院

【出处】

：

中国高原医学与生物学杂志

【发表日期】

：

2020年4期

【关键词】

：

癫痫低级别胶质瘤预后生物信息学 epilepsy low-grade gliomas prognosis bioinformatics

【基金项目】

：

国家自然科学基金资助项目(81860762),青海省2018年科技计划基础研究计划项目(2018-ZJ-721),青海省卫生计生科研指导性计划课题(2018-wjzdx-131)

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目的基于生物信息学探讨癫痫相关基因对低级别胶质瘤(LCG)患者预后的影响,并初步挖掘其作用机制。方法从NCBI CEO数据库获取伴有或不伴有癫痫的LCG患者的芯片数据(CSE32534);用GEO2R算法比对筛选差异基因;利用DAVID数据库对癫痫相关基因进行CO功能和KECG通路分析;用STRINC数据库构建蛋白互作网络并多算法筛选Hub基因;利用GEIPA+TIMER数据库分析Hub基因对LCG患者预后及免疫细胞浸润的影响。结果共筛选出46个癫痫相关基因,主要富集在神经递质传递、关键启动子结合、胞外基

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