矿区成矿围岩经历基性熔岩与火山碎屑岩两次成岩作用,水晶矿的成矿先后经历了3个成矿阶段。不同成矿阶段水晶单形晶面种类、晶体形貌、颜色、包裹体等有明显的不同,根据这些特征可划分水晶矿的成矿阶段与矿物世代。紫色及"三色层"水晶产出在第1成矿阶段的玄武岩气孔中;条带状水晶及乳白色、纯净无色水晶与板状绿帘石产出在第2成矿阶段的玄武岩层间滑动裂隙或晶洞中;第3成矿阶段的火山碎屑岩的气孔或晶洞或裂隙脉中,产出以红色赤铁矿为主,伴有绿帘石与绿纤石、玉髓及玛瑙。扫描电镜研究表明"三色层"水晶中的赤铁矿球粒具三圈层构造,条带状水晶中的赤铁矿管状包裹体是两圈层构造的中空管。水晶流体包裹体均一温度及拉曼光谱研究表明,矿区水晶矿属低温热液(150~190℃)成矿,成矿流体的盐度较低(w(NaCl)=5.7%~13.2%),其中紫晶盐度最高(13.2%),条带状水晶盐度较低(6%)。流体包裹体主要由H2O和SO2及微量的CH4组成。