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目的:分析社区公共卫生机构在传染病疫情预防中的应用效果.方法:以我市社区公共卫生服务标准、覆盖率与建设条件不同的城、乡社区为例,研究时间为2019年1月-2020年5月,对照组为农村社区资料,观察组为城市社区资料,各抽选146人进行调查.两组传染病防控知识掌握程度与疾病发生率比较.结果:观察组传染病防控知识各项评分均高于对照组的(P<0.05);观察组总发生率(4.11％)低于对照组(10.27％)(P<0.05).结论:社区公共卫生机构对传染病疫情的预防中的作用显著,可有效降低居民疾病的传染率,值得推广.