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上海自贸区的建设对南通实施创新驱动战略发展带来了机遇和挑战。南通实施创新驱动战略具有优势与劣势,上海自贸区建设有利于南通进行制度和理念创新,其溢出效应对南通的产业结构升级有促进作用;同时也使得南通与周边城市之间的竞争日趋激烈,造成南通地区技术人才流失。为此,要主动对接上海自贸区、培育创新人才、营造创新文化环境,积极应对挑战。