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参照高校科技创新能力的内涵和结构，建立高校科技创新评价的指标，并运用因子分析法进行实证分析。结果表明：科技创新基础和投入因子、科技创新环境因子、科技服务投入和科研成果人力效率综合因子，对我国高校科技创新能力的解释能力比较强，其后依次为科技成果转化因子、科研成果经费效率因子。对各省市的科技创新能力进行了分析，并提出了相应的政策建议。