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目的 研究不同来源禽流感病毒H5N1亚型血凝素(hemagglutinin,HA)氨基酸序列的变异及变异规律. 方法 以GenBank公开的禽流感病毒H5N1亚型HA氨基酸序列为材料,利用生物信息学的手段分析其同源性及氨基酸变异规律. 结果 46个禽流感病毒H5N1亚型HA氨基酸序列之间的同源性为90%～100%;同一地区来源的氨基酸之间的同源性大于异地来源的同源性;在H5N1亚型HA氨基酸序列中,天冬酰氨酸、丝氨酸、苏氨酸、精氨酸和天门冬氨酸最常发生突变. 结论 禽流感病毒H5N1亚型血凝素氨基酸序列的变异呈现出一定的规律.