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期刊论文
DNA序列的甲基化特征提取软件
DNA序列的甲基化特征提取软件
来源 :生物信息学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Kimyueyue
【摘 要】
:
提取(量化)特征是DNA甲基化状态预测中的一个关键步骤,然而不同的方法所使用的特征并不相同,特征量化的具体过程计算繁琐。本文集成文献中的重要特征,设计并实现了DNA序列的特
【作 者】
:
戴胜冬
杨昆
顾靓
王路路
【机 构】
:
杭州电子科技大学计算机学院
【出 处】
:
生物信息学
【发表日期】
:
2012年1期
【关键词】
:
DNA甲基化
特征提取
CPG岛
BLAT
软件
DNA methylation feature extraction CpG island BLAT Soft
【基金项目】
:
国家自然科学基金(No.60903086)
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提取(量化)特征是DNA甲基化状态预测中的一个关键步骤,然而不同的方法所使用的特征并不相同,特征量化的具体过程计算繁琐。本文集成文献中的重要特征,设计并实现了DNA序列的特征提取软件工具。该软件封装了特征的计算过程,可以方便地批量计算目标序列的相关特征,为后续的数据分析和挖掘提供便利。
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